Filmul începe cu o prezentare a lui Thomas Andersen, care duce o viață obișnuită, neremarcabilă. Lucrează toată ziua, iar când se întoarce acasă, se dedică ceea ce iubește: hacking sub porecla Neo.
Într-o zi, Tom o întâlnește pe Trinity, care este interesată de același lucru. Tinerii se întâlnesc într-un club de noapte. Mai târziu, de la prietenul fetei, Morpheus, tipul află că există o altă realitate, Matrix.
Neo se oferă două capsule: albastru și roșu. Primul înseamnă să uiți totul și să fii acasă, iar al doilea îți va oferi șansa de a vedea întregul adevăr.
Andersen o alege pe cea din urmă și vede paralela cu propriii ochi. Și, spre marea mea dezamăgire, este groaznică. Lumea este condusă de mașini care au transformat omenirea în sclavie. Au nevoie de o persoană pentru a reproduce energia. Iar lumea „normală” este doar o iluzie.
Neo se alătură războiului de gherilă care se desfășoară în ambele lumi. El trebuie să se sacrifice pentru a elibera sclavii programului.
Viața lui Thomas Anderson este împărțită în două părți: ziua este un angajat de birou obișnuit, care primește mustrări de la superiori, iar noaptea se transformă într-un hacker pe nume Neo și nu există niciun loc în rețea la care să nu poată ajunge. Dar într-o zi totul se schimbă - eroul, fără să-și dorească, află adevărul teribil: tot ceea ce îl înconjoară nu este altceva decât o iluzie, Matrix, iar oamenii sunt doar o sursă de putere pentru inteligența artificială care a înrobit omenirea. Și doar Neo are puterea de a schimba echilibrul de putere în această lume extraterestră și teribilă.